Pomocí chemických sloučenin zvaných hormony ovlivňuje takové funkce, jako je růst a pohlavní vývoj, vyrovnává hladinu živin v krvi a reakce organismu na stres.
Hlavními orgány hormonální jsou žlázy s vnitřní sekrecí, kam patří nadledvinky, štítná žláza, příštitná tělíska, epifýza ( šišinka), hypofýza (podvěsek mozkový), brzlík, slinivka břišní a pohlavní žlázy – vaječníky u žen a varlata u můžu.
Hypotalamus, který je vlastně částí nervového systému, se také považuje za žlázu s vnitřní sekrecí, protože tvoří několik hormonů. Hypofýza – podvěsek mozkový – řídí činnost všech ostatních žláz s vnitřní sekrecí.
Epifýza ( šišinka) – ovlivňuje spánek a bdění i růst reprodukčních orgánů.
Hypotalamus – útvar v mozku spojuje nervový a hormonální systém.
Štítná žláza – reguluje metabolismus a energetickou hladinu.
Hypofýza ( podvěsek mozkový) – hlavní žláza řídící činnost všech dalších žláz s vnitřní sekrecí.
Nadledvinky – tyto žlázy ovlivňují organismus mnoha způsoby. Aktivují jej při stresu, udržují v rovnováze tělní tekutiny a regulují metabolismus a vývoj pohlavních znaků.
Příštítná tělíska – udržují správnou hladiny vápníku v krvi.
Brzlík – pomáhá při tvorbě protilátek důležitých v imunitním systému.
Slinivka břišní – reguluje hladinu cukru v krvi.
Vaječníky – produkují ženské hormony, které podmiňují druhotné pohlavní ženské znaky.
Varlata – tvoří mužské pohlavní hormony, které podmiňují druhotné pohlavní znaky muže ( mužský vzhled).